Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp3Q8R4B8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp3Q8R4B8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms