Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms