Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf4Q8R368 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms