Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc12Q8R344 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms