Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms