Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc12Q8K5B8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms