Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccm2Q8K2Y9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms