Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms