Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms