Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsnQ8CIT9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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