Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx8Q8CFD4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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