Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms