Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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