Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp27Q8CEG8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp27Q8CEG8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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