Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc63Q8CDV6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc63Q8CDV6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms