Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms