Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssuh2Q8C3L1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms