Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l1Q8C0J2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l1Q8C0J2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms