Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn17Q8BXA6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn17Q8BXA6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn17Q8BXA6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn17Q8BXA6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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