Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp38Q8BW70 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms