Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s2Q8BSZ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms