Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Prpf18Q8BM39 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Prpf18Q8BM39 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Prpf18Q8BM39 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prpf18Q8BM39 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf18Q8BM39 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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