Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc2Q8BKV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc2Q8BKV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc2Q8BKV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms