Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG7

Comtd1, Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Comtd1Q8BIG7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Comtd1Q8BIG7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Comtd1Q8BIG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms