Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrtm2Q8BGX3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms