Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms