Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms