Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms