Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Negr1Q80Z24 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Negr1Q80Z24 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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