Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b1Q80VQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b1Q80VQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b1Q80VQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b1Q80VQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms