Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms