Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms