Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2lQ7TS74 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms