Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms