Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SyncripQ7TMK9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms