Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwistnbQ78WZ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms