Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms