Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2r2Q6ZWZ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms