Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih3Q6ZWS4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih3Q6ZWS4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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