Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms