Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinlQ6ZQ12 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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