Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CenpeQ6RT24 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms