Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a1Q6PEM8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms