Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms