Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms