Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms