Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm2bQ6P1G2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm2bQ6P1G2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms