Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slx4Q6P1D7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms