Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Colgalt2Q6NVG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Colgalt2Q6NVG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms