Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms